Publications (ORCID 0000-0002-7046-6194)

2018

Ahmed, M. B., dos Santos, K.C.G., Sanchez, I.B., Petre, B., Lorrain, C., Plourde, M. B., Duplessis, S., Desgagné-Penix, I., Germain, H. (2018). A rust fungal effector binds plant DNA and modulates transcription. Scientific Reports. 8(1) pp1-14

Cabanillas, D.G., Jiang, J., Movahed, N., Germain, H., Yamaji, Y., Zheng, H., Laliberte. J.-F. (2018) Turnip Mosaic Virus Uses the SNARE Protein VTI11 in an Unconventional Route for Replication Vesicle TraffickingTHE PLANT CELL, In Press. DOI: 10.1105/tpc.18.00281

Madina, M.H.,  Zheng; Germain, H. (2018) New insight into bulb dynamics in the vacuolar lumen of Arabidopsis cells. Botany. 96(8):511-520 DOI.10.1139/cjb-2018-0009

 

Laperriere, G. Desgagné-Penix, I., Germain, H. (2018). DNA distribution pattern and metabolite profile of wild edible lobster mushroom (Hypomyces lactifluorum/Russula brevipes). Genome. 61:329-336.

 

Germain, H., Joly, D.L., Mireault, C., Plourde, M.B., Letanneur, C., Stewart, D., Morency, M.-J., Petre, B., Duplessis, S., Séguin, A. (2018). Infection assays in Arabidopsis reveal candidate effectors from the poplar rust fungus that promote susceptibility to bacteria and oomycete pathogens. Molecular Plant Pathology. 19:191-200. DOI 10.1111/mpp.12514

 

.......................................................................................................................................................

 

2017

Taylor, S., Laperriere, G., Germain, H. (2017). Droplet Digital PCR versus qPCR for gene expression analysis with low abundant targets: from variable nonsense to publication quality data. Nature Scientific Reports 7, article number 2409.

 

.....................................................................................................................................

 

 

2016

 

Fakih, Z., Ahmed, M.B., Letanneur, C., Germain, H. (2016). An unbiased nuclear proteomics approach reveals novel nuclear protein components that participates in MAMP-triggered immunity. Plant Signaling and Behavior.  11:6 (e1183087)

 

Gaouar, O., Morency, M.-J., Letanneur, C., Séguin, A., Germain, H. (2016). The 124202 candidate effector of Melampsora larici-populina interacts with membranes in Nicotiana and Arabidopsis. Canadian Journal of Plant Pathology 38:2, 197-208.. DOI 10.1080/07060661.2016.1153523
 
Petre B, Hecker A, Germain H, Tsan P, Sklenar J, Pelletier G, Séguin A, Duplessis S and Rouhier N. (2016). The Poplar Rust-Induced Secreted Protein (RISP) Inhibits the Growth of the Leaf Rust Pathogen Melampsora larici-populina and Triggers Cell Culture Alkalinisation. Front. Plant Sci. 7:97. doi: 10.3389/fpls.2016.00097
 
Dong, O.X., Meteignier, L.-V., Plourde, M.B., Ahmed, B.M., Wang, M., Jensen, C., Jin, H., Moffett, P., Li, X., and Germain, H. (2016). Arabidopsis TAF15b localizes to RNA processing bodies and contributes to snc1-mediated autoimmunity. Molecular Plant-Microbe Interactions. 29:4 (247-257)

.....................................................................................................................................

 

2014


 
Chaudhari, P., Ahmed, B., Joly, D.L., Germain, H. 2014. Effector biology during biotrophic invasion of plant cells. Virulence. 5:7 (1-7)
 
Mireault, C., Paris, L.-P., Germain, H. 2014. Enhancement of the Arabidopsis floral dip method with XIAMETER OFX-0309 as alternative to Silwet L-77 surfactant. Botany. 92:1-3  

 

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2013


 
Emmanuel Milot, Marie Lecomte, Hugo Germain, Frank Crispino. 2013. The National DNA Data Bank of Canada: A Quebecer perspectiveFrontiers in Statistical Genetics and Methodology. 4 (249).
 
Germain, H., Gray-Mitsumune, M., Houde, J., Benhamman, R., Sawasaki, T., Endo, Y., Matton, D.P. 2013. The Solanum chacoense ovary receptor kinase 11 (ScORK11) undergoes tissue-dependent transcriptional, translational and post-translational regulation. Plant Physiology and Biochemistry. 70, 261-268.
 
Gaouar, O. and Germain H., 2013. mRNA export: threading the needle. Frontiers in Plant Microbe Interactions. 4(59)1-5. Special issue on nucleocytoplasmic trafficking in imunity. 

 

.....................................................................................................................................

 

2012


Germain, H., Lachance, D., Pelletier, G., Fossdal, C.G., Solheim , H., Séguin, A. 2012. The expression pattern of the Picea glauca Defensin 1 promoter is maintained in Arabidopsis thaliana, indicating the conservation of signalling pathways between angiosperms and gymnosperms. Journal of Experimental Botany, 63(2) 785-795.

 

.....................................................................................................................................

 

2011

 

 
Germain, H., Li, X. Research on molecular plant-microbe interactions in Canada. 2011. The Americas Journal of Plant Science and Biotechnology. 5(S1) 115-120.
 
Germain, H., Séguin, A. 2011. Innate immunity: has poplar made its BED ? New Phytologist. 189(3) 178-187. 

 

.....................................................................................................................................

 

2010

 

 
Germain, H., Na, Q., Cheng, Y.T., Lee, E.K., Huang, Y., Dong, O.X., Gannon, P., Huang, S., Ding, P., Li, Y., Sack, F., Zhang, Y., and Li, X. 2010. MOS11: a new component in the mRNA export pathway. PLoS Genetics.
   
Wiermer, M., Germain, H., Cheng, Y., Garcia, A., Parker, J.E. and Li, X. 2010. Nucleoporin MOS7/Nup88 contributes to plant immunity and nuclear accumulation of defense regulators. Nucleus  1, 332-336
 
 
 Monaghan, J., Germain, H., Weihmann, T., and Li, X. 2010. Dissecting plant defense signal transduction: Modifier of snc1 in Arabidopsis. Canadian Journal of Plant Pathology. 32(1) 35-42.


................................................................................................................
 

2009

 

 

Germain, H., Bergeron, M.J., Bernier, L., Laflamme, G., and Hamelin, R.C. (2009). Patterns of colonization and spread in the fungal spruce pathogen Onnia tomentosa. Molecular Ecology. 18 (21) 4422-4433.
 
 
 Chen H.,  Xue L., Chintamanani S., Germain H., Lin H., Cui H., Cai R.,  Zuo J., Tang X., Li X.,  Guo H., and Zhou J-M. 2009. ETHYLENE INSENSITIVE3 and ETHYLENE INSENSITIVE3-LIKE1 Repress SALICYLIC ACID INDUCTION DEFICIENT2 expression to negatively regulate plant innate immunity in Arabidopsis.  The Plant CelL, (8) 2527-2540.
 
 
Cheng  Y.*, Germain  H.*, Wiermer  M.*, Bi D.*, Xu F., García A., Wirthmueller  L., Després  C., Parker  J., Zhang  Y., and Li X. 2009. Nuclear Pore Complex Component MOS7/Nup88 Is Required for Innate Immunity and Nuclear Accumulation of Defense Regulators in Arabidopsis. The Plant Cell, 21(8) 2503-2516.


.....................................................................................................................................

 

 2008

 

 

Germain, H., Gray-Mitsumune M., Matton D.P. 2008. ScORK17, a transmembrane receptor-like kinase predominantly expressed in ovules is involved in seed development. Planta, 228(5):851-62.

 

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2007

 

 Germain, H., Houde, J., Gray-Mitsumune, M., Sawasaki, T., Endo, Y., Rivoal, J., Matton, D.P. 2007.  Characterization of ScORK28, a transmembrane functional protein receptor kinase predominantly expressed in ovaries from the wild potato species Solanum chacoense. FEBS Letter, 581, 5137-5142.

 

 

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 2006

 

Germain, H., E. Chevalier and Matton D.P. 2006. Plant bioactive peptides: an expanding class of signaling molecules. Botany 84(1): 1-19.

 

 

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 2005

 


Germain, H.,Rudd, S., Zotti, C., Caron, S., O'Brien, M., Chantha, S.C., Lagace, M., Major, F., and Matton, D.P. 2005. A 6374 Unigene Set Corresponding to Low Abundance Transcripts Expressed Following Fertilization in Solanum chacoense Bitt, and Characterization of 30 Receptor-like Kinases. Plant Mol Biol 59, 515-532.


*Germain, H., *Chevalier, E., Caron, S., and Matton, D.P. 2005. Characterization of five RALF-like genes from Solanum chacoense provides support for a developmental role in plants. Planta 220, 447-454.

 

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 2002


Germain, H., Laflamme, G., Bernier, L., Boulet, B., and Hamelin, R.C. 2002. DNA polymorphism and molecular diagnosis in Inonotus spp. Canadian Journal of Plant Pathology 24, 194-199.



*Indicates co-first author/*Indication de co-premier auteur

 

Invited presentation

Molecular dissection of plant immunity through the use of virulence factor

 

Roorkee, Uttarakhand, India

August 23rd, 2018

Effectors as probes of the plant immune system...and more!

 

Israel Society for Microbiology 

Tiberias, Galile, Israel.

 

November 23rd, 2017

Effectors as probes of the plant immune system...and more!

 

Tel Aviv University, Tel Aviv.

George S. Wise Institute

November 21st, 2017

Effectors as probes of the plant immune system...and more!

 

Seminar at Ben Gurion University of the Desert.

November 20th 2017.

Using effectors to probe plant cell biology

 

Seminar at Université Paul Sabatier, Toulouse, France

25-10-2016

Using effectors to probe plant cell biology

 

Seminar at INRA of Nancy, France

24-10-2016

 

Using effectors to probe plant cell biology

 

Seminar at INRA of Toulouse, France

24-10-2016

 

Le champignon crabe: démystifié!

 

Assemblée Générale Annuelle de Association pour la Commercialisation des Produits Forestiers Non-Ligneux.

Pour visiter le site web de l'ACPFNL cliquer ici

26-04-2016

Découverte de facteurs de virulence fongique via un système hétérologue.

 

Département de Biologie 

Université de Moncton

 

Invited by David Joly.

 

To visit David's web site click here.

 

Une combinaison d'approches in silico et fonctionnelles met à jour des effecteurs de rouilles

Journée International de Biotechnologie (JIB), Hamammet, Tunisie, Decembre 20-24, 2014.

 

 

 

 

 

 

Molecules at war, virulence factors from biotrophic pathogens as probe of the plant immune system

Biology Department, Stewart Building November 10th, 2014.

 

Pourquoi (et surtout comment) étudier l’immunité chez les plantes ?

Stratégies d’attaques et de défenses: derrière les lignes ennemies

Invitation de l'Association des étudiants en biologie médicale. 26 Septembre 2014.

A quoi servent les facteurs de virulence...comment les étudier: approche cellulaire.

Biogames Janvier 2014. Séminaire St-Joseph, Trois-Rivières, Québec

 

 

Virulence factors of plant pathogens, where do they go and why are they going there?

Plant Science Departement, Research Horizon Seminar, November 28th, 2013.

 

SCBV
SCBV

Probing the Arabidopsis proteome  with fungal effectors from biotrophic pathogens 

Meeting of the Canadian Society of Plant Biology, Québec City 2013.

 

Plants are constantly attacked by pathogens (fungi, bacteria, insects, virus). Some of these pathogens are biotrophic; those are pathogens that depend on their host survival. In this intricate lifestyle the pathogen must suppress the plant immune system (to prevent the plant from launching a defense response) while it feeds from the plant without killing it. To achieve its goal the pathogen relies on proteinaceous effectors that are transferred into the host with the aim of suppressing the host immunity and hijack the host cells to feed. We use the model plant Arabidopsis thaliana to assess whether these predicted fungal effectors can interfere with the plant immune system. Our multi-faceted strategies involves; labor intensive plant infection, generation of stable transgenics expressing GFP-tagged effector to assess subcellular effector localization, proteomic identification of effector targets and genetics. Ultimately, the objectives are two-fold: 1) discover new functional effectors used by a given pathogen, 2) to use these predicted effectors to probe the A. thaliana immune system to discover new components involved in plant immunity. Ultimately this knowledge could be used in crop improvement strategy, in addition we wish to demonstrate that Arabidopsis could be used a reservoir of resistance genes for crops.

 

 

Les facteurs de virulences pour améliorer la résistance aux pathogènes ! Centre Sève, Sherbrooke, Janvier 2013.

Les facteurs de virulence procurent aux pathogènes qui les possèdent un bénéfice lors de l’infection de l’hôte; suppression de la réponse immunitaire, entrée dans la cellule, colonisation et acquisition de nutriments. Les champignons pathogènes biotrophes, notamment les rouilles, possèdent des facteurs de virulences. Cependant, comme ces organismes ne peuvent généralement être transformés, les approches usuelles de génomique fonctionnelle d’altération d’expression de gènes ne sont pas envisageables pour comprendre les fonctions géniques de ces organismes. Pour déterminer les fonctions de 20 facteurs de virulences potentiels de la rouille foliaire du peuplier (Melampsora larici-populina, Mlp), nous utilisons une approche qui consiste à transférer des gènes de Mlp dans Pseudomonas syringae que nous utilisons ensuite pour infecter Arabidopsis thaliana. Un accroissement du pouvoir infectieux de P. syringae, suite à l’ajout du gène, nous indique si celui-ci contribue à l’infection. Ultimement, notre intérêt réside dans l’identification des cibles intracellulaires, potentiellement des protéines régulant la réponse immunitaire végétale. Pour ce faire, nous utilisons des approches protéines-protéines combinés à des approches génétiques qui nous ont à ce jour permis d’identifier deux cibles potentielles. L’une d’elles est une synaptotagmine alors que l’autre est un récepteur kinase non caractérisé dont l’expression est accrue lors de stress biotique. L’approche présentée représente une méthode de choix pour l’étude des facteurs de virulence d’organismes biotrophes et nous amène à découvrir de nouvelles composantes de l’immunité végétale.

 

IBIS/U laval Nov.2009
IBIS/U laval Nov.2009

 

Nucleocytoplasmic trafficking in plant innate immunity, IBIS-Proteo/ Université Laval/Pavillion Marchand, Québec, 2009.

Les réponses immunitaires des plantes dépendent de voies de signalisation se rendant au noyau. L’accumulation nucléaire de protéines de résistance (R) et d’autres éléments de signalisation de la réponse de défense est nécessaire à leur fonction mais notre compréhension de cette relocalisation est limitée. Je présenterai nos travaux sur mos7, un mutant perte de fonction partielle qui supprime la réponse auto-immune médiée par la protéine de résistance snc1. Le mutant simple mos7 est altéré aux niveaux de l’immunité basale, de l’immunité médiée par les gènes R et dans la résistance systémique acquise. La protéine MOS7, est une nucléoporine qui régule l’accumulation nucléaire des régulateurs de défense EDS1, NPR1 et de la protéine R, snc1 selon un mécanisme CRM1-dépendent.

L'immunité végétale et le transport nucléocytoplasmique. Séminaire au Centre de Foresterie des Laurentides, Québec, 2008.

 

Les réponses immunitaires des plantes dépendent des protéines de résistances (R). De récents travaux ont démontrés que certaines de ces protéines  peuvent être localisée au niveau du noyau. Cependant, les autres facteurs permettant cetet relocalisation nucléaire sont à ce jour inconnu. Je présenterai nos travaux sur mos7, un mutant perte de fonction partielle qui supprime la réponse auto-immune médiée par la protéine de résistance snc1. Le mutant simple mos7 est altéré aux niveaux de l’immunité basale, de l’immunité médiée par les gènes R et dans la résistance systémique acquise. La protéine MOS7, est une nucléoporine qui régule l’accumulation nucléaire des régulateurs de défense EDS1, NPR1 et de la protéine R, snc1. A ce jour il s'agit de la première démonstration d'une protéine R dont la localisation et l'effet est régulé par une nucléoporine.

APS meeting Summer 1999.
APS meeting Summer 1999.

Molecular diagnosis of I. tomentosus. American Phytopathology Society (APS), 1999.

 

Inonotus tomentosus is an important causal agent of root and butt rot of conifer. However cultures of Inonotus tomentosus are extremely hard to differentiate from Inonotus leporinus and Phellinus pini which can be associated with similar ecological niches. We designed PCR primers that are specific to I.tomentosus and do not amplify for other Inonotus or P. pini. In addition a phylogenic analysis of various Inonotus species suggest that ecological niches was an important driving force for speciation.

 

 

SPPQ 1999
SPPQ 1999

Développement de marqueurs moléculaires de gènes codant permettant de détecter la présence de polymorphisme chez Inonotus tomentosus à l’aide d’une approche PCR-SSCP, Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), 1999.

180 basidiocarpes du pathogène Inonotus tomentosus a été utilisé pour générer des données moléculaires (mitochondrial et nucléaire) et spatials permettant de mesurer la taille des genets, la diversité moléculaires et les évênements ayant mené à la colonisation du site infecté. Les marqueurs utilisés de même que des conclusion préliminaire liées à la colonisation du site seront présentées.

Journal Cover

Dynamic signaling events across the nuclear envelope are an important component of plant immune responses. Cheng et al. (pages 2503–2516) report cloning and analysis of Arabidopsis MOS7/Nup88, which encodes a nucleoporin-like protein that functions in regulating nuclear export of certain defense proteins. MOS7 is a homolog of human and Drosophila Nup88, which regulates nuclear export of activated NF-κB transcription factors. mos7 mutant plants show marked reduction in nuclear retention of SNC1 and the immune regulators EDS1 and NPR1 and exhibit specific defects in immune responses, suggesting that plant defense outputs are regulated by MOS7-mediated modulation of the nuclear concentration of defense proteins. The cover displays a confocal image of leaf pavement cells stained with propidium iodide (red/magenta) showing nuclear rim localization of MOS7- GFP (green). Picture taken by Yuti Chen.

Book or book chapters

Functional analysis of receptor kinase
Functional analysis of receptor kinase

 

 

Germain, H. 2009. Functional Genomic of Receptor Kinases in Solanum Chacoense. VDM Verlag. 220 pages. ISBN: 3639180674

 

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La culture des champignons sous couvert forestier est un domaine en plein essort. Dans ce livre, magnifiquement illustré, rédigé par Fernand Miron et Anita Royer nous avons contribué à un chapitre expliquant comment les outils moléculaires peuvent aider au développement de la culture des champignons sous couvert forestier.

 

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Auteur : Fernand Miron et Anita Royer

Réalisation : Filière mycologique de la Mauricie - Syndicat des producteurs de bois de la Mauricie

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Illustrations : 411 photographies en couleur

Parution : Octobre 2015

ISBN 978-2-9808585-4-3

Diffusion et distribution : Fernand Miron et Anita Royer, Shawinigan-Sud (Québec)

 

Courriel : champimiroy@hotmail.com